跨境电商在开展无票采购业务时，如何有效运用市场采购1039政策，是一个值得探讨的问题。首先，我们需要了解市场采购1039政策的内涵和适用范围。市场采购1039政策，是我国针对市场采购贸易方式出台的一项税收优惠政策。通过这一政策，跨境电商可以在没有发票的情况下，采购商品并进行出口，从而降低成本，提高效益。

在实际操作中，跨境电商应充分利用市场采购1039政策的优势，合规地进行无票采购。具体操作包括：了解政策的具体规定，掌握政策适用的条件和流程；与供应商进行沟通，确保他们了解并支持跨境电商使用市场采购1039政策；在采购过程中，保存好相关单据，以备查验；在出口环节，按照政策要求，进行申报和缴税。

同时，跨境电商还需要关注市场采购1039政策的动态变化，以便及时调整经营策略。此外，跨境电商还应注重合规经营，遵守我国及相关国家的法律法规，确保经营活动的合法性。

总的来说，跨境电商在开展无票采购业务时，应合理运用市场采购1039政策，以降低成本，提高效益。同时，还要注重合规经营，确保经营活动的合法性。